El cáncer de ovario epitelial constituye la primera causa de muerte asociada al cáncer ginecológico en mujeres adultas en países desarrollados, con supervivencias globales a cinco años prácticamente inalterada en las últimas décadas que no superan el 45%. Por ello es prioritaria la definición de biomarcadores pronósticos y predictivos que contribuyan a elevar esta cifra.  

   Por otra parte, aunque actualmente se conocen algunos genes de riesgo asociados con el cáncer de ovario (BRCA1, BRCA2, RAD51C, RAD51D o BRIP1), más del 50% de la susceptibilidad a padecer este cáncer permanece inexplicada. Determinar el gen de susceptibilidad dentro de una familia es clave, no sólo para la prevención y detección precoz, sino que puede tener implicaciones de cara al tratamiento como sucede con las pacientes BRCA1 o BRCA2, particularmente sensibles a inhibidores de PARP.

   Teniendo en cuenta estos retos, nuestras principales líneas de investigación son:

• La definición de nuevos factores pronósticos y predictivos basados en el genoma e inmunogenicidad de los tumores
  

   En nuestro grupo la información genética de los tumores juega un papel central en la búsqueda de nuevos biomarcadores. Más allá de los cambios individuales en la secuencia del ADN, buscamos identificar patrones globales de alteraciones en el genoma tumoral con potencial impacto clínico (por ejemplo, patrones relacionados con las firmas mutacionales, los perfiles de ganancia y perdida de material genético o con el grado de inestabilidad de regiones microsatélites). Con estos marcadores pretendemos optimizar la estratificación de los pacientes de acuerdo con la agresividad de su enfermedad y orientar de forma individualizada los tratamientos mediante la anticipación de la respuesta a los mismos. Dentro de esta línea estamos interesados en explorar la interacción entre los biomarcadores genómicos y la inmunogenicidad tumoral. Buscamos comprender cómo la combinación de estos dos aspectos puede informar sobre la evolución tumoral y ofrecer perspectivas innovadoras para el diseño de estrategias terapéuticas más efectivas.

•  La identificación de genes y variantes genéticas asociados con la susceptibilidad al cáncer de ovario

   En esta área de trabajo utilizamos distintas estrategias que incluyen el estudio de familias de riesgo altamente seleccionadas y estudios de casos y controles en el contexto de colaboraciones con consorcios internacionales que permiten evaluar miles de pacientes. Esta línea incluye la caracterización en profundidad de las variantes candidatas para dilucidar su patogenicidad incluyendo herramientas in silico y estudios funcionales in vitro.

•  La elucidación de la relevancia clínica de los defectos en “Mismatch Repair” (MMR) en cáncer de ovario

   La correcta identificación de tumores con alteraciones en el MMR ha cobrado especial relevancia en los últimos años ya que se ha descrito que responden favorablemente a tratamientos con inmunoterapia. Por ello estamos analizando las características moleculares y clínicas de tumores de ovario con alteraciones en esta ruta y generando, mediante el uso de herramientas de aprendizaje automático, un predictor de defectos en el MMR basado en características del genoma tumoral. Con este predictor buscamos superar las limitaciones existentes de las técnicas diagnósticas estándar y favorecer una correcta estratificación de las pacientes para orientar adecuadamente las decisiones clínicas.

      Nuestro grupo utiliza un enfoque multidisciplinar que integra abordajes “ómicos”, de biología molecular y celular, análisis bioinformáticos y estrecha colaboraciones con expertos clínicos y computacionales.