Farmacogenómica y Biomarcadores Tumorales

El principal interés del Grupo de Farmacogenómica y Biomarcadores Tumorales (@PGx_IIBM) es comprender cómo la variación genómica modifica la respuesta al tratamiento farmacológico, con el objetivo final de utilizar este conocimiento para diseñar tratamientos farmacológicos más específicos.

En el cáncer, el fracaso terapéutico es un importante problema clínico y urge desarrollar estrategias de farmacológicas más seguras y eficaces. Nuestra máxima prioridad es mejorar la supervivencia y la calidad de vida de los pacientes con cáncer. Para ello, nos centramos en el descubrimiento de nuevos mecanismos de sensibilidad/resistencia a los fármacos antitumorales, la identificación de biomarcadores predictivos de respuesta al tratamiento y la propuesta de nuevas vulnerabilidades terapéuticas del cáncer. La identificación de variantes genéticas de la línea germinal que aumentan el riesgo de toxicidad tras un tratamiento farmacológico, es también una parte fundamental de nuestros objetivos. 

Para alcanzar estas metas, llevamos a cabo una investigación traslacional que integra la genómica y la bioinformática con la experiencia clínica de los departamentos de oncología.
Nuestros objetivos son:  

1) Identificar mutaciones driver/ secundarias que estratifiquen los tumores en subgrupos moleculares con un significado clínico para la respuesta farmacológica.
Nuestro trabajo se centra principalmente (aunque no exclusivamente) en el carcinoma de células renales (CCR) y sus tratamientos: fármacos antiangiogénicos, inhibidores de puntos de control inmunitarios, inhibidores de HIF2a. En la histología de células claras del CCR, nos centramos en comprender el papel de las mutaciones en los remodeladores de la cromatina, utilizando grandes colecciones de tumores y modelos in vitro e in vivo. En otras histologías del CCR, las alteraciones en el ciclo de Krebs que conducen a una acumulación de oncometabolitos y a la pseudohipoxia son partes esenciales de nuestra investigación.

2) Definición de biomarcadores pronósticos y nuevas vulnerabilidades tumorales. 
Estamos interesados en descubrir nuevas dianas terapéuticas e indicadores de enfermedad agresiva en cánceres genitourinarios esporádicos, cáncer de riñón hereditario (por ejemplo, la enfermedad VHL, la leiomiomatosis hereditaria y cáncer de células renales) y cáncer de ovario.

3) Descubrimiento y validación de marcadores germinales predictivos de la toxicidad de fármacos. 
Basándonos en nuestra experiencia previa en neuropatía periférica inducida por fármacos, estamos estudiando la toxicidad de conjugados anticuerpo-fármaco como el deruxtecan trastuzumab. Para ello, utilizamos estrategias de genes candidatos y estrategias sin hipótesis previa, como los estudios de asociación de genoma completo (GWAS). Además, para impulsar la implementación de la farmacogenética en la clínica, exploramos la reutilización de datos NGS para extraer marcadores farmacogenéticos bien conocidos.

Esta investigación se sustenta en un equipo interdisciplinar con experiencia en tecnologías genómicas de alto rendimiento, acceso a grandes colecciones de tumores/muestras con anotación clínica y colaboración activa con grupos clínicos y asociaciones de pacientes (por ejemplo, la Alianza Española de la enfermedad VHL). Contribuciones previas de nuestro grupo incluyen: la identificación de alteraciones somáticas y de línea germinal asociadas a la respuesta a fármacos antiagiogénicos en cáncer renal (Lancet Oncology, Ann Oncol, JCI Insight, Eur Urol); descubrimiento de variación de línea germinal que conduce a un mayor riesgo de neuropatía periférica inducida por paclitaxel (Genet Med, Clin Can Res); reutilización de datos de secuenciación de exoma completo para extraer/descubrir marcadores farmacogenéticos de toxicidad (NPJ Genom Med, Genet Med); identificación de nuevos biomarcadores de susceptibilidad, pronóstico y predicción del cáncer mediante tecnologías ómicas (Nature Genetics, Genet Med).

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