Programas

 

En esta sección encontrareis documentación sobre diferentes programas para visualización y análisis de imágenes.

Para los usuarios del IIB, recordaros que la instalación de los programas la realiza el personal del servicio de informática, nosotros solamente os proporcionamos la información sobre donde obtenerlo.

 

Programas de las casas comerciales para ver las imágenes adquiridas en los microscopios del servicio:

 

  • El programa de Zeiss para visualizar las imágenes del confocal LSM710 lo podeis obtener en este link: Zen lite (Zeiss)
  • El programa libre para la visualización, modificación y edición de los videos realizados en el Cell Observer lo podeis descargar en este link: Axiovision
  • En el microsocopio Nikon E400 de la facultad hemos instalado una cámara Leica monocroma, el programa que la maneja es el LAS X y la versión gratuita para instalaros en vuestros ordenadores es esta LAS X Lite

 

Programas libres para visualizar y cuantificar cualquier tipo de imagen:

 

  • ImageJ

Este software de análisis de imágen es libre y tiene infinitas posibilidades. Se pueden realizar análisis de colocalización, contajes de partículas, medidas de intesidad de fluorescencia, medición de áreas...

Para descargároslo teneis aqui el link: Descarga de ImageJ

Si necesitais ayuda para el manejo o el análisis de las imágenes poneros en contacto con nosotros.

Aqui teneis información que os puede resultar interesante:

Tutorial para iniciarse en el uso del Image J

Manual general de Image J

Basic Image Analysis and Manipulation in ImageJ

 

  • Fiji (Fiji is just ImageJ) 

Este software es el mismo que el ImageJ pero tiene incluídos muchos plugins interesantes y se acutaliza frecuentemente. Os lo recomendamos.

Para descargároslo aqui teneis el link: FIJI

En esta dirección podeis encotrar múltiples tutoriales que os pueden ayudar en vuestros análisis: Tutoriales FIJI

 

  • Versiones de ImageJ que inlcuyen diversos plugins que facilitan el trabajo

ImageJ adaptado por la universidad de Oviedo: Uniovi ImageJ

 WCIF-ImageJ

 

  • Existen multiples plugins o aplicaciones que os pueden ser de utilidad tanto para el ImageJ como para el Fiji

Para análisis de colocalización os recomendamos el JACOP y el ICA. Aunque existen mucho más.

Si estais interesados en analizar el movimento individual de partículas o células de manera manual os aconsejamos que os descargueis el pluging  "MANUAL TRACKING", es muy sencillo de usar, aqui os dejamos las instrucciones.

Si además quereis realizar gráficas para representar los datos obtenidos anteriormente podeis usar el programa Chemotaxis and migration tool. El manual lo podeis descargar en este link: Chemotaxis and migration tool.

Para análisis de ensayos de herida os recomendamos:

Wound healing tool o T-Scratch